Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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