Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Pde6cQ91ZQ1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pde6cQ91ZQ1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
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Pde6cQ91ZQ1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Pde6cQ91ZQ1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pde6cQ91ZQ1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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Pde6cQ91ZQ1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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