Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rprd1aQ8VDS4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms