Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf183Q8QZS5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rnf183Q8QZS5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Rnf183Q8QZS5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rnf183Q8QZS5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rnf183Q8QZS5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms