Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prpf39Q8K2Z2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prpf39Q8K2Z2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prpf39Q8K2Z2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prpf39Q8K2Z2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prpf39Q8K2Z2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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