Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c1Q8K193 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms