Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tbc1d23Q8K0F1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tbc1d23Q8K0F1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms