Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Lrit1Q8K099 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Lrit1Q8K099 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrit1Q8K099 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Lrit1Q8K099 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lrit1Q8K099 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lrit1Q8K099 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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