Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab43Q8CG50 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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