Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Hpf1Q8CFE2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms