Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms