Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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