Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Lrif1Q8CDD9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Lrif1Q8CDD9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Lrif1Q8CDD9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrif1Q8CDD9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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