Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms