Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Atg4aQ8C9S8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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