Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Znf428Q8C1M2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms