Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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