Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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