Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms