Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ctdsp2Q8BX07 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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