Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp38Q8BW70 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp38Q8BW70 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp38Q8BW70 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp38Q8BW70 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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