Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms