Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc172Q810N9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc172Q810N9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms