Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms