Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Amigo1Q80ZD8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms