Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Npm2Q80W85 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms