Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SnupnQ80W37 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms