Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rpp38Q80UU2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rpp38Q80UU2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rpp38Q80UU2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpp38Q80UU2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rpp38Q80UU2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpp38Q80UU2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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