Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms