Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
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