Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clec18aQ7TSQ1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms