Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClmQ7TSN2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms