Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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