Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf18Q7TS55 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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