Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ScocQ78YZ6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms