Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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