Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rad54bQ6PFE3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rad54bQ6PFE3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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