Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nup98Q6PFD9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nup98Q6PFD9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nup98Q6PFD9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nup98Q6PFD9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nup98Q6PFD9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup98Q6PFD9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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