Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm29Q6PDI5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms