Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms