Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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