Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms