Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms