Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt40Q6IFX3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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