Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms