Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fgd6Q69ZL1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms