Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms