Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pkp4Q68FH0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pkp4Q68FH0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pkp4Q68FH0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pkp4Q68FH0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pkp4Q68FH0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pkp4Q68FH0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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