Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Irf4Q64287 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Irf4Q64287 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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