Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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